ＪＲの駅としては橋上駅です。隣に、高架駅の近鉄の桜井駅があります。そもそも両路線は向いている方向が違うため、運転本数・車両数・乗降客数が大きく違うということが駅に短時間いるだけでもよく分かります。とは言っても、線名にもなるぐらいの、桜井線の主要駅です。